Während Sergeant Voight versucht herauszufinden, wer hinter der Ermordung von Jin steckt, erhalten die Mitglieder aller Geheimdienste Todesdrohungen von einer unbekannten Gruppe namens "Shadow". Die Stadt stürzt ins Chaos, als "Shadow" mehrere Feuer, Exposionen und Raubzüge verursacht.

Die Abteilung beginnt Ermittlungen in einer Reihe von Morden die alle eine Gemeinsamkeit haben: Die Opfer haben einen Dollar-Schein an die Brust gesteckt bekommen. Dank Ruzek findiger Hilfe erfährt Voight, dass ein enger Freund an einigen düsteren Geschäften beteiligt ist.

Das Kopfgeld, das auf Halstead ausgesetzt ist, hat fatale Konsequenzen als ein unschuldiger Barkeeper einem für Halstead bestimmten Kopfschuss zum Opfer fällt. Voight und sein Team müssen schnell handeln, um den Auftragskiller aufzuhalten.

Die Suche nach zwei versmissten Mädchen setzt das Team unter gewaltigen Zeitdruck. Die Spur führt Halstead, Antonio und Lindsay in eine Mietskaserne, wo sie einen dringend nötigen Hinweis finden.

Bei dem Versuch, Olive zu helfen, wird Voight überfallen und entführt. Als er am nächsten Tag nicht zum Dienst erscheint, werden die Kollegen misstrauisch und machen sich auf die Suche nach ihm.

Nach dem Tod eines 10-jährigen Mädchens hat das Team eine Spur, die sie ins Innere eines Gefängnisses führt. Ruzek und Atwater werden als Insassen eingeschmuggelt, um den Fall dort weiter zu verfolgen.

Das Team bekommt Unterstützung von der SVU aus New York. Die Kollegen sollen helfen, einen Pädophilen-Ring dingfest zu machen. Das Crossover beginnt in Chicago Fire S03E07 Freunde und Helfer (I) und geht weiter in Law & Order: Special Victims Unit S16E07 Täter und Opfer (II)

Die Intelligence Unit bearbeitet den Fall eines reichen Diamantenhändlers, der fast vor den Augen Antonios erschossen wird.

Eine Drogenrazzia bringt Olinskys Familie in Gefahr. Olinskys Frau wird von den verdächtigen Dealern festgehalten. Burgess und Roman arbeiten mit Jenn Cassidy zusammen, Romans ehemaliger Freundin.

Die Routineuntersuchung eines vermeintlichen Terroristen führt dazu, dass Burgess sich im Krankenhaus wiederfindet und die Intelligence Unit einer genau geplanten Mordserie nachgehen muss

Lindsay bearbeitet ihren ersten Fall für die Taskforce und braucht die Unterstützung von Voight und dem Intelligence-Team. Burgess ist zurück auf dem Revier, muss aber den Empfang betreuen, während Sergeant Platt mit Roman auf Streife geht.

Die Intelligence Unit kämpft sich durch ein Dickicht an widersprüchlichen Hinweisen zum Mord an einer Mutter und ihrer Tochter.

Antonio und seine Schwester Gabriela statten Adrian Gish, dem Mann, von dem sie annehmen, dass er das Feuer gelegt hat, in dem Shay umgekommen ist, im Büro einen Besuch ab. Gemeinsam mit den Streifenpolizisten Burgess und Roman setzt die Intelligence Gish unter Druck, um ihn zu einem Geständnis zu bewegen. Platt verhält sich merkwürdig. Sie ist ungewöhnlich gut gelaunt, freundlich und zuvorkommend. Das Crossover beginnt in Chicago Fire S03E13 Der Brandstifter (I).

Lindsays Mutter ist in einen grausamen Fall von Raubüberfällen verwickelt.

Burgess und Roman nehmen es mit einer gefährlichen Schmugglerbande auf, ohne sich verteidigen oder Hilfe rufen zu können.

Als ein Drogenfahnder vermisst wird, lässt sich Antonio in eine gefährliche Diebstahlbande einschleusen, um verdeckt zu ermitteln.

Während einer Weltwirtschaftskonferenz ermitteln die Mitglieder der Intelligence Unit verdeckt in verschiedenen Protestbewegungen, um Gefahrenpotentiale zu ermitteln. Ruzek wird Teil der „Black Grid“, einer Gruppe Umweltschutz-Extremisten, und freundet sich mit Sierra an. Als sie stirbt, verdächtigt die Intelligence den argentinischen Staatsminister Fabian Sosa.

Voight unterhält verdächtige Beziehungen zu einem vermissten Teenager, der an einem missglückten Raubüberfall auf einen Drogentransport beteiligt war.

Nachdem mehrere Leichen von jungen Chinesinnen in einem Fabrikgebäude in Chinatown entdeckt werden, beginnt die Suche nach einem der berüchtigtsten Kriminellen Chicagos.

Das Chicago Intelligence-Team erhält Unterstützung durch SVU-Detectives, um einen Fall in Chicago mit einem ungelösten Fall in New York zu verbinden, bei dem ein Jahrzehnt zuvor Opfer vergewaltigt und ermordet wurden. Das Crossover beginnt in Chicago Fire S03E21 Kühler Empfang (I), wird in dieser Episode fortgesetzt und findet in Law & Order: Special Victims Unit S16E20 Für Nadia (III) seinen Abschluss.

Während Revier 21 versucht, den Tod einer Kollegin zu verarbeiten, wird das Team gezwungen, persönliche Gefühle zurückzustellen und den Anschlag auf ein beliebtes Café aufzuklären. Es gibt mehrere Verdächtige, aber nur eine junge Augenzeugin.

Eine Massenschießerei zwingt das Intelligence-Team in eine wilde Verfolgungsjagd, um ein Mordkommando daran zu hindern, erneut zuzuschlagen.

Der pensionierte Commander Perry bittet Voight und das Team um Hilfe bei der Befreiung seines Neffen aus einer Gruppe korrupter Polizisten, die Drogendealer ausrauben. Als die Dinge schief gehen, muss Voight eine jüngere, gewalttätigere Version seiner selbst zur Strecke bringen. Währenddessen kämpft Lindsay darum, clean zu bleiben. Gleichzeitig nimmt eine Frau aus Olinskys Vergangenheit Kontakt zu ihm auf.