Vier Monate nachdem Nathan in letzter Sekunde verhindern konnte, dass der explodierende Peter New York ins Verderben reißt, begegnen sich die Helden in sehr desolatem Zustand wieder.

Ein verloren geglaubter Held unterstützt irische Gangster bei ihren Verbrechen, Doktor Suresh sucht nach dem Haitianer, und Kenseis besondere Fähigkeit kommt ans Tageslicht.

Suresh entdeckt ein erschreckendes Gemälde des Zukunftsmalers Isaac Mendez, Maya nutzt ihre tödlichen Fähigkeiten für eine Befreiungsaktion, und zwei alte Bekannte kehren zurück.

An Monica Dawson zeigen sich unerwartete neue Fähigkeiten, Angela Petrelli macht ein schockierendes Geständnis, und Maya und Alejandro stoßen auf eine furchtbare Entdeckung.

Ein verlorener Held wird in Irland von einer mysteriösen Mörderin gesucht, und Matt fahndet mit einem unerwarteten Helfer in Philadelphia nach einer alptraumhaften Bedrohung.

West bringt Claire dazu, Debbie eine Lektion zu erteilen, Suresh muss ein moralisches Dilemma lösen, und Hiro versucht, die Geschichte Japans wieder in Ordnung zu bringen.

Suresh, Matt, Nathan und Bob schließen sich gegen die Angriffe eines gefährlichen Gegners zusammen, und Hiro erlebt gemeinsam mit Kensei das Ende ihrer gemeinsamen Reise.

In einer Reihe von Rückblenden wird klar, wie Peter seine Atomexplosion überlebte, welches Opfer D.L. für Niki und Micah brachte und wie Maya ihre dunklen Kräfte entdeckte.

Hiro kehrt in die Gegenwart zurück und erfährt von einem Todesfall, Suresh trifft eine wichtige Entscheidung, und Peter trifft auf jemanden, der den Schlüssel zu seiner Vergangenheit besitzt.

Da es Peter nicht gelingt, in die Zukunft zurückzukehren, um Caitlin zu retten, will er unbedingt den Ausbruch des tödlichen Shanti-Virus verhindern.

In Texas stoßen Peter und Nathan auf Matt und Hiro, Micah brauch die Hilfe seiner Mutter, und Maya erfährt durch die Entführung von Molly und Suresh, was für ein Monster Sylar ist.