Die Lage scheint für Sarah aussichtslos, denn sie wird weiterhin erbarmungslos von ihren Gegnern gejagt. Verzweifelt versucht sie ihre Tochter Kira ausfindig zu machen, die wohl von Rachel entführt wurde. Sarah schwört Rache und begibt sich auf einen Kriegspfad gegen Rachel. Allison weilt derweil mit Donnie bei der Beerdigung von Aynsley, woraufhin sie mehr und mehr Schuldgefühle bekommt. Cosima muss unterdessen eine komplizierte Entscheidung treffen, welche schwerwiegende Konsequenzen nach sich ziehen könnte.

Sarah bittet Art um Hilfe auf der Suche nach ihrer Tochter Kira und ist dann zutiefst entsetzt, wohin die Spur die beiden führt. Während Alison immer noch Aynsleys Tod schwer zu schaffen macht, muss sich Cosima mit den immer heftiger werdenden Symptomen ihrer mysteriösen Krankheit herumplagen.

Nachdem sich Sarah mit Felix auf den Weg gemacht hat, ist sie dazu gezwungen, sich an einen alten Bekannten zu wenden: Ihre ehemalige Flamme Cal Morison. Ihre kurze Verschnaufspause findet aber rasch ein jähes Ende und Sarah erkennt wieder einmal, dass egal wie weit sie auch versucht wegzurennen, ihr immer wieder jemand auf den Fersen ist.

Sarah kehrt für Antworten nach Hause zurück und mit Cosimas Hilfe taucht sie tiefer in die Geheimnisse hinter dem Klonexperiment ein. Ihre Nachforschungen bringen sie alsbald zur Wurzel allen Übels. Um sich aber wieder aus der prekären Situationen zu befreien, in der sie sich wiederfindet, muss sie eventuell einen höheren Preis bezahlen, als es ihr lieb ist.

Auch Rachel macht nun Nägel mit Köpfen, indem sie es auf Sarah's Liebsten und Nächsten abgesehen hat und diese attackiert. Sarah versucht diese wiederum zu beschützen, doch ein unerwarteter Besucher droht, ihre Pläne zu vereiteln.

Sarah verbündet sich mit einem unerwarteten und vor allem unzuverlässigen Partner, um einer Spur von Hinweisen zu folgen, welche sie wiederum zu den Ursprüngen des Experiments führen könnte. Cosima stößt derweil gemeinsam mit Delphine auf eine Lösung, wie man ihre Krankheit eventuell erfolgreich behandeln könnte. Allison befindet sich unterdessen in seltsamer Gesellschaft, während sie ihre Reha abhält.

Als eine Vertraute aus dem Rehabilitationszentrum Alison hintergeht und droht, die Wahrheit über Aynsleys Tod zu enthüllen, gerät sie kurz vor dem Familientag in einen emotionalen Abwärtsstrudel. Donnie und die Kinder sind für einen Besuch eingeplant und so müssen alle Klone mithelfen, um das drohende Desaster zu vermeiden.

Ein neuer Spieler der Klonverschwörung taucht an Felix' Türschwelle auf, was ihn sofort in den Krisenmodus versetzt. Cosima gehen unterdessen die Optionen aus, und so muss sich Sarah entscheiden, ob sie ein wichtiges Druckmittel aufgibt und einen Deal mit Dyad eingehen soll.

Der Krieg mit Dyad ist beinahe verloren, als Rachels jüngster Trick Sarah zur Aufgabe zwingt. Die Klone schließen sich zusammen - in der Hoffnung, Sarah noch retten zu können. Während sie im Kampf für ihre Freiheit stecken, trifft Sarah auf einen neuen Partner und enthüllt eine furchteinflößende neue Dimension der Verschwörung.

Rachels jüngster Plan zwingt Sarah zur Aufgabe, während sich der Klonclub zusammenschließt, um sie zu retten.