Clary Fray a 18 ans et étudie l'art, lorsqu'elle découvre qu'elle est une Shadowhunter et fait partie d'un monde caché au bord de la guerre.

Clary est bien décidée à recouvrer la mémoire. Elle fait appel aux mystérieux frères silencieux, accompagnée de ses nouveaux alliés.

Lorsque le clan des vampires new-yorkais kidnappe Simon, Jace forme Clary afin qu'elle puisse se joindre à leur mission de sauvetage.

Clary se rapproche du mystérieux sorcier Magnus Bane pour invoquer le démon qui s'est emparé de ses souvenirs, tandis qu'un lourd secret concernant Alec est dévoilé.

Lancés à la recherche d'indices pour retrouver Valentin, Clary et Simon se retrouvent nez à nez avec la meute de loups-garous de New York.

Alors qu'il lutte pour sa survie, Luke, blessé, révèle à Clary l'histoire secrète qui l'unit à Jocelyn et Valentin.

Avant d'atteindre la Coupe Mortelle, les Shadowhunters vont devoir affronter les nombreux démons et autres personnages suspicieux se dressant sur leur chemin.

Pendant que Clary songe à ressusciter Simon en vampire, à l'Institut, l'apparence de Lydia Branwell oblige Alec à faire un sacrifice.

Lydia divise les opinions en décidant d'emmener Meliorn dans la Cité des Ténèbres pour l'interroger, tandis que Simon tente de contrôler ses nouveaux pouvoirs.

Avant de pouvoir retrouver Valentin, Clary doit d'abord évoluer dans un monde parallèle pacifiste, dans lequel les Shadowhunters, devenus inutiles après qu'ils sont venus à bout des démons, n'existent plus. Pendant que Clary essaie de ne pas se laisser emprisonner dans cette réalité parallèle, les choses tournent mal à l'Institut...

Malgré ses doutes, Clary décide de s'allier à Michael Wayland, le père de Jace, longtemps présumé mort, pour venir en aide à Jocelyn.

Alec lutte contre ses véritables sentiments envers Magnus. Clary et Jace font face à une surprenante révélation alors qu'ils cherchent de l'aide pour rompre un sort.

La dernière chance pour Clary de réveiller sa mère la contraint à demander de l'aide à la personne qu'elle redoute le plus. Jace souffre d'avoir été trahi par Hodge.